Jesteś w: Start Projekty PLGrid Plus Dziedziny nauki Bioinformatyka

Bioinformatyka

Tematyka

Jednym z kluczowych obszarów bioinformatyki jest modelowanie zjawisk związanych z aktywnością makromolekuł. Dostarczenie zestawu narzędzi pozwalającego z dużą wydajnością prowadzić badania w tej dziedzinie pozwoliłoby zespołom pracującym nad rozwojem metod i ich zastosowań w badaniach biologicznych podnieść jakość tych badań.

Grid tematyczny z zakresu bioinformatyki ma istotne znaczenie dla badań w zakresie farmakologii i biotechnologii, w szczególności dla projektowania leków in silico. Ma więc obok znaczenia poznawczego głęboki sens praktyczny poprzez zastosowanie w medycynie.

Rezultatem prac prowadzonych w tym gridzie dziedzinowym będzie uniwersalnie dostępny zestaw narzędzi bioinformatycznych umożliwiających prowadzenie badań w dziedzinie biologii molekularnej. W szczególności dotyczy to identyfikacji białek i przewidywania ich roli w procesach biologicznych. Narzędzia te zostaną utworzone na bazie istniejących i stosowanych w wiodących polskich laboratoriach bioinformatycznych metod i modeli do przewidywania struktury przestrzennej białek, przewidywania oddziaływań makromolekuł biologicznych z innymi makromolekułami oraz z drobnocząsteczkowymi związkami chemicznymi.

W ramach tego gridu tematycznego:

  • stworzone zostaną narzędzia do składowania i analizy eksperymentów genetycznych – sekwencjonowanie DNA
  • wykorzystanie będzie oprogramowania UNICORE
  • stworzone zostaną narzędzia do wizualizacji danych medycznych zintegrowanych z przepływami zadań i/lub osadzonych w portalu
  • stworzone zostaną narzędzia do przeprowadzania i analizy procesu fałdowania białek.

 

Zaangażowane instytucje

  • Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego
  • Centrum Astronomii Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu
  • Zakład Bioinformatyki i Telemedycyny Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego

 

Cele

  • Cel główny: analiza danych bioinformatycznych.
  • Cele specyficzne:
    • stworzenie mechanizmów i zasobów do składowania i udostępniania sekwencji DNA
    • adaptacja oprogramowania do porównywania sekwencji DNA
    • rozwój narzędzi dostępowych (portale, etc.)

 

Użytkownicy

Docelowo: wszystkie zespoły zajmujące się badaniami DNA.

 

Wdrożone usługi

Analiza Danych Genetycznych
Analiza Danych Genetycznych II
Składowanie Danych Genetycznych

 

Kontakt

Koordynatorzy Gridów Dziedzinowych

tytuł tytuł
Copyright © 2017, Konsorcjum PL-Grid. Wszelkie prawa zastrzeżone.
UWAGA! Ten serwis używa cookies i podobnych technologii (brak zmiany ustawień przeglądarki oznacza zgodę na to).