Life Science
Tematyka
„Life science” jest szeroko definiowaną grupą dziedzin nauki, które z definicji dotyczą żywych organizmów, w tym ludzi, zwierząt oraz roślin. Do tej grupy zalicza się biologię, biotechnologię, genomikę, proteomikę, farmację i biomedycynę, a także – wg niektórych źródeł – bioinformatykę. Podstawowym obszarem zastosowań gridu tematycznego Life Science jest biotechnologia, m. in. techniki stosowane w kilku kategoriach:
- DNA/RNA: sondy DNA, inżynieria genetyczna, sekwencjonowanie / synteza / amplifikacja DNA/RNA, ekspresja genów, technologia antysensowa
- białka i inne cząsteczki: sekwencjonowanie / synteza / inżynieria białek i peptydów, poprawa metod transportu dużych cząsteczek leków, proteomika, izolacja i oczyszczanie, przekazywanie sygnałów, identyfikacja receptorów komórkowych
- komórki, kultury komórkowe i inżynieria komórkowa: kultury komórkowe i tkankowe, inżynieria tkankowa, fuzja komórkowa, szczepionki i immunizacja, manipulacje na zarodkach
- geny i wektory RNA: terapia genowa, wektory wirusowe
- techniki procesów biotechnologicznych: biosynteza z wykorzystaniem bioreaktorów, bioinżynieria, biokataliza, bioprocesowanie, bioługowanie, biospulchnianie, wybielanie za pomocą środków biologicznych, bioodsiarczanie, bioremediacja, biofiltracja
- nanobiotechnologia: zastosowanie narzędzi i procesów nano / mikroproduktów do konstrukcji urządzeń do badań biosystemów oraz w transporcie leków, udoskonalania diagnostyki, etc.
- bioinformatyka: tworzenie genomowych / białkowych baz danych, modelowanie złożonych procesów biologicznych, biologia systemowa.
Wdrożone usługi
- Platforma integromicznych analiz danych z mikromacierzy DNA – usługa stworzona z myślą o osobach przeprowadzających badania biologiczne z użyciem mikromacierzy DNA. Pomaga analizować informację o poziomie ekspresji genów oraz korelować ją z innymi danymi klinicznymi odnośnie badanych organizmów. Dostępna pod adresem: lifescience.plgrid.pl.
- Galaxy – środowisko planowania i wykonywania analiz danych, pozyskanych z sekwenatorów nowej generacji (usługa w trakcie przygotowania).
- GeneSpring GX – oprogramowanie firmy Agilent pozwalające w sposób przystępny przeprowadzać analizy statystyczne oraz wizualizować dane mikromacierzowe. Dostępne pod adresem: genespring.plgrid.pl.
Zaangażowane instytucje
- Klaster LifeScience
- ACK Cyfronet AGH
- Katedra Biochemii Klinicznej Collegium Medicum – Małopolskie Centrum Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
- Zakład Bioinformatyki i Telemedycyny, Uniwersytet Jagielloński Collegium Medicum
- Katedra i Zakład Biologii Molekularnej, Śląski Uniwersytet Medyczny
- Centrum Badań Translacyjnych i Biologii Molekularnej Nowotworów, Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie, Oddział w Gliwicach
- Wydział Neurofarmakologii Molekularnej, Instytut Farmakologii, Polska Akademia Nauk
- Laboratorium OMICRON, Wydział Lekarski Uniwersytetu Jagiellońskiego - Collegium Medicum
- Instytut Zootechniki, Państwowy Instytut Badawczy
Materiały promocyjne
Broszura nt. Life Science w PLGrid Plus
